
近日,长沙医科专科大学独一所属医院科室王学浩科学院院士创业团队在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,蛋清互作组和靶点正能量分解检测分析服务。
日语主题词:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
简体中文题目:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
用户计量单位:南京医科大学
学习原材料:细胞
拜谱可以提供服务性:转录组测序+淀粉酶互作组+靶点能源排泄组
方法路线地图:
探讨最后
01、YBX1被监定为HCC中糖酵解的关健表观遗传
本研究方案信息采集HCC良性肺部淋巴癌症样本量(n=7)的单生殖生殖肿瘤细胞RNA测序统计资料集来进行深入概述,发掘糖酵解特异性通常集中点在良性肺部淋巴癌症生殖生殖肿瘤细胞中,hdWGCNA深入概述甄别出9个人类基因信息模块(图1A-G)。TCGA-LIHC列队的生活工作深入概述断定YBX1为自由生活工作风险性情况(图1H)。进步骤结合起来IHC、WB实践和良性肺部淋巴癌症机构与周围非良性肺部淋巴癌症机构的位置转录组学统计资料集断定YBX1是肝生殖生殖肿瘤细胞癌医治的隐藏的靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被确保为转换HCC细胞系糖酵解的重中之重环境因素
02、YBX1推动HCC中的有氧糖酵解和繁殖
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向疗法激光能量消化吸收组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1促使HCC中的有氧糖酵解和增值能力
03、OGT与YBX1根据并驱动YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,淀粉酶互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1构建并增强YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化增进其磷碱化,进而有助于其核转位
进第三步测量YBX1的O-GlcNAc糖基化可不可以影向其磷碱化,在OGT敲低的HCC体细胞核中或用OGT克药物制剂OSMI-1补救,YBX1淀粉酶平行同质性下降,YBX1磷碱化同质性可以减少(图4A-C)。IP实验操作展现,在相同之处的Flag-YBX1底物平行下,YBX1-WT的磷碱化平行同质性多于YBX1-T57A,阐明磷碱化的新增不但仅是可能更强的YBX1淀粉酶展现(图4D)。溶合了核和质类物质看见TMG补救的HCC体细胞核中YBX1核展现的上升(图4E-F),进第三步看见YBX1磷碱化的首要上下调整要素是AKT(图4G-I)。这类看见关注O-GlcNAc糖基化经由力促其磷碱化来资料YBX1淀粉酶增强性并力促核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 表达重要于其进那步發生磷硝化作用表达并就能够驱动其核转位
05、YBX1驱动PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1有利于PKM2转录
06、YBX1 还可以从而提高组淀粉酶乳酸性反应体现情况
学习出现 YBX1敲低差异性减少蛋清质乳碱化,非常是H3K18乳碱化(图6A-C)。糖酵解促使剂2-DG的研究查证了糖酵解与组蛋清乳碱化的进行连接,促使糖酵解可差异性减少H3K18la品质(图6D)。PKM2过表答爱不可逆转转YBX1敲低引起的H3K18la增涨,之外源乳酸操作不只提高自己H3K18la,还周期性YBX1表答爱上涨,温馨提示有着同向回访(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR查证,H3K18la在聚集于YBX1发动子进行推进其转录,该环节受O-GlcNAc糖基化国家宏观调控(图6H-J),并出现 P300 上涨是YBX1增強H3K18乳酰化成用的策略(图6K-L)。
图6.YBX1增强学习H3K18乳过酸修饰语情况
一篇文章个人心得体会
在种科研中报到了YBX1在HCC中高表明,同时与糖酵破译切一些。YBX1在T57处被O-GlcNAc遮盖,最后相对稳定胆固醇质并多其表明。种遮盖还促使YBX1在T57处的磷碱化,促使其核易位。因,一项整个过程激发了糖酵解一些什么是人类基因的转录并多种多样乳酸的带来。虽然,YBX1提高P300的转录,必将win7驱动组胆固醇的乳碱化,特殊是H3K18la,H3K18乳碱化双向自我调节YBX1什么是人类基因转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观显性基因双面馈环体系图
拜谱总结
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱生物技术为该研究提供了转录组测序,蛋白质互作组和靶向疗法卡路里排泄组技术服务,拜谱怪物建立了完善成熟的转录组学、球蛋白组学、翻译资料后突显组学、消化吸收组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
参照文献
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.